绍天二年，夏。
整个局势变的更加扑朔迷离起来，随着绍天帝的亲征北伐，明军以攻代守，全线反击，东起登莱，西至川陕，到处都在发起进攻。
甚至后方的云南、台岛等地，也开始在打仗。
黔国公沐天波丢失昆明逃往永昌，昆明、蒙化、大理先后失守，分守副使杨畏知、推官王运开坚守楚雄，死战不屈。
皇帝闻报后特旨云南，进杨畏知为云南巡抚，李乾德仍为云南总督。
云南总兵官、黔国公沐天波许戴罪立功，授云南提督，并调四川建昌总兵曹勋，贵州提督皮熊率部南下，
调广西提督、平蛮将军陈邦傅，桂林镇总兵焦琏领广西兵西进云南，
协同进攻沙定洲，收复昆明、大理等地。
又下旨加封石屏土司，悍将龙在田为副提督衔、临安镇总兵官。
嶍峨土司王扬祖、宁州土司禄永命、景东土司刁勋等各授副将、参将等，令他们征召土兵协剿叛乱。
虽然云南偏远，鞭长莫及，但皇帝仍然还是在御驾亲征山东的同时，关注着云南，并在四川局势有所稳定后，立马从四川和贵、广西抽调兵马过去平乱。
沙定洲在占领昆明，夺取武定、姚安、大理、蒙化诸州府后，胁迫俘虏的云南巡抚吴兆元、在籍大学士禄丰人王锡衮向朱以海上疏，反称沐天波反，他沙定洲讨平之，宜以代镇云南。
想得到朝廷的正式任命，取代沐氏。
对于这种无理要求，朱以海自然不能答应，沙定洲是土司，之前被沐天波征召协助讨平叛乱土司，事后却在昆明兵变发难，夺取省城，然后攻掠云南，若是承认沙定洲代镇云南，那还得了。
好在云南局势虽坏，也没坏到底，沐天波年轻，没有本事，只能一逃再逃，逃到了永昌府保山去了，但云南也不是没人了，如杨畏之，本来只是分守道，一介文官，但却能够据守楚雄这座小城，硬是抗住了沙定洲叛军围攻。
叛军攻下了大理蒙化，却攻不下就在昆明旁边的楚雄。
此外如石屏土司龙在田，是一员猛将，早在万历年间就已经率领土兵出头，之后多次受朝廷征召率土兵参与平定叛乱、围剿农民军等战斗，崇祯年间在熊文灿麾下，还曾经奉命监视受招安的张献忠部，张献忠对龙在田都十分佩服，还主动拜他为义父。
之前武定土司吾必奎趁机发动叛乱，沐天波就是召集龙在田、沙定洲等土司出兵平定，将其击败生擒。
只是后来沙定洲又趁机做乱，龙在田却也是坚决反对，如今保沐天波退守永昌。