以后，近卫军不归属兵部，只归属于自己，而自己所建立的这几个部门分掌近卫军在军事指挥、人事组织、武器保管与制造、后勤供应方面的事务。
毕竟，按照朱厚照的设想，将来近卫军就主要负责对外战争，因而现将近卫军的指挥、人事与后勤装备供应大权从兵部剥离出来是目前最急切的。
组建机构倒是不难，表面上来说，朱厚照自己就可以决定，但问题是组建机构后官员的任命和在任命中可能引起的政治变动。
现在的大明在军事上主要是文官掌管指挥，武官负责执行，内臣负责监军，基本上是重文抑武，重制衡不重效率，朱厚照决定在近卫军改变这种形式，提高武将地位，但是也不是说就排斥文官进入军事系统。
毕竟按照大明现在的情况，很多文官也因为常年在边镇带兵后有了带兵经验。
朱厚照想在近卫军取缔文武之分，本来在后世，就没有文武之分，只有军政之分，所以朱厚照决定从整个大明官僚体系中选择知兵的官员进入近卫军领导体系，不分文武，唯才是举。
最终，马文升兼任了总参谋部尚书一职，许进兼任了总政治部尚书，而总后勤部尚书则由户部左侍郎王琼兼任，总装备部尚书则由工部尚书曾鉴兼任。
似乎一开始，整个近卫军中央机关的领导成员依旧都是些文官。
但这也没办法，重文抑武现象存在了这么多年，使得大明现在真正知兵的军事人才几乎都是文臣，一时间，即便朱厚照想利用强权改变文官掌指挥的现象也不可能，只能慢慢来。
以后等到有了专门的军事学堂后或许才能有专业的军事人才负责军事战争活动，而让文武之分彻底消失。
朝臣们其实不是很理解皇帝陛下为何把禁兵与京营的军队改为近卫军，而且还成立专门的领导机关来，只有朱厚照自己知道他这是要改变大明的军事制度，并让大明拥有一支可以进行对外扩张的强大军队。
成立了近卫军的领导机关，就意味着近卫军从上到小的机构建立基本完善，而接下来，则是要这五个领导机构开始进行各自的工作。
其中，总参谋部则是要确定近卫军的作战任务。
朝臣不明白现在非战争时期，而且近卫军又是京畿军队，为何要制订作战任务。
但朱厚照的意思就是要让近卫军有作战任务，要对外扩张，最终，朱厚照和马文升等确立的第一个作战任务便是收复河套。
按照大明以往的规则，决议这种军事性质的政务自然是要内阁票拟，皇帝决断的，但现在朱厚照改变了这种方式，而是由近卫军总参谋部拟定作战计划，报请他这个皇帝批准，甚至都不经过内阁和司礼监！
但因为现在内阁和司礼监都是唯朱厚照之命是从的，因而也都没有异议，没有阻止朱厚照的行为，朱厚照知道大明其实很多政治制度都没有一个成文的规定，从体统上来说，皇帝决定一切，无论何事都是皇帝自己做主。
皇帝宠信宦官时，所有权力自然归于宦官，包括军权。
皇帝信任内阁时，所有权力归于内阁，包括军权。
所以这就导致大明有时候是宦官专权有时候是文官专权。
但朱厚照现在决定把大明的政治制度以明文法律的形式确立下来，这样也避免后世之君臣随意转移帝国统治权力，一会儿让宦官专权一会儿文官专权，甚至到最后皇帝连皇权都无法保障。
为此，在让近卫军总参谋部拟定收复河套的作战计划时，他也召集在京四品以上的文武大员和各部堂官以及御史言官召开廷议，决议制定一部《钦定宪法大纲》，主要通过法律的形式规定君上大权与臣民权利义务。
因为朱厚照还不想让大明变成一个宪政国家，为保障自己的皇权，他所要求制定的宪法，与后世的宪法还是有所不同，至少没有限制君权一说，当然也没有一味强调和解释君权神授，只是以明文规定帝王拥有的权力与权力的分配和臣民的权利义务。
譬如，皇帝拥有大明帝国最高军事指挥权与最高人事任命权等，以及内阁与司礼监的职权以及近卫军与兵部所管辖的卫所兵和边军的职权与义务，和军事战争发起的程序等。
很多朝臣们皆对此感到很新鲜，同时也觉得很有意义，也都觉得把帝国君王权力以及臣民权利义务规定清楚很有必要，对于宪法这个词，他们也不陌生，毕竟在《国语》中便有“赏罚惩奸，国之宪法”一句，都知道宪法的含义。
但也有很多官员对此颇为非议。
一些官员发现《钦定宪法大纲》这个东西一旦出来，只会保障皇权，对自己这些官绅没半点好处！
因为一旦帝国所有的人都遵循《钦定宪法大纲》来执行职权的话，那他们就不能再以什么祖制和圣人之言和尧舜之类的来劝谏和祖制帝王。
毕竟《钦定宪法大纲》明文规定皇帝拥有对大明一切军政大事的决策权，也就意味着只要皇帝决定了，就无人能阻止。
但事实上，按照大明现有的惯例，皇帝的政令有时候是可以被封驳的，只要官员们决定皇帝的政令不对，虽然可能因此付出生命的代价，但至少没人会说官员们这样做是不对的，是违背法令的。
可如今，朱厚照一旦要制定颁布《钦定宪法大纲》，就意味着没人可以阻止皇帝的任何决定，否则就是违背宪法。
因而，在关于《钦定宪法大纲》制定的廷议上，便有吏科给事中艾晟直接反对道：“陛下！圣明之朝无不以孝治天下！如今设一宪法治天下，则恐有悖于人伦！”
“设宪法如何有悖于人伦？你具体说明一下！”朱厚照问道。
则艾晟一时语塞，作为文臣，向来是空谈便是，何必问其根由，说有悖就是有悖，为何还要具体说明。
但朱厚照这样问，这艾晟也不好不回答，只道：“按理以孝治天下，当是父为子纲，君为臣纲。”
“设宪法便是对此做具体说明和规定，朕是君王，君为臣纲，所以宪法才规定了君王拥有最高决策权，这矛盾吗，比如父为子纲这个，也在宪法中规定了子女当从父母之言，这不都是秉承以孝治天下的理念吗？”
朱厚照这么一问，艾晟不知该如何回答，也无法否认宪法中所规定的和自己所言的矛盾。
“臣愚笨，请陛下恕罪！”
艾晟只好退了下去，一时不知该如何说，但他自己清楚，其实他是想说陛下你要与士大夫共治天下的，你当皇帝要尊重士绅们的意见，但是这些都是不成文的规矩，大明没有任何法典说过要皇帝与士大夫共治天下，甚至连孟子的一些涉及君权的话都被太祖朱元璋给删掉了。
但这时候，还是有官员也借孟子的一些言论开始批驳朱厚照的宪法，礼部左侍郎杜龙便道：“陛下！圣人言，君为轻，民为重，社稷次之！宪法当以民为重！以天下百姓之利为重！”
朱厚照没想到这杜龙还提出了“民权”观点，心想就凭他这句话都快成为卢梭级人物了，便道：
“杜卿说的对，民当为重，朕没有异议，既然如此，那便在宪法里加上，今后无论王公大臣还是贩夫走卒，都不得夺民之财夺民之性命，大明子民拥有生命财产权，地方亲民之官不得随意打杀百姓，若致百姓死者，当偿命！若致百姓伤者，当赔偿！天下臣民罪责只依据大明律以及大诰执行！由大明三法司审理决议。”
朱厚照知道这些官员目的是想限制君权故而提出民权，对此朱厚照也不介意，你要自己这个皇帝尊重民权可以，毕竟这也是一种进步嘛，但你们士绅阶层不能只让朕这个皇帝尊重民权，你们不尊重民权啊。
“杜卿觉得如何，只要你和在场的朝臣们都觉得能让天下官员士绅乃至王公贵族尊重百姓权利，朕也可以尊重！”
朱厚照这么一说，这杜龙当场语塞，他自然无法做到让天下所有的官员都做到尊重百姓权益，连他自己也做不到。
“臣书生之见，惹陛下笑话，陛下恕罪！”杜龙红着脸退了下去。
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