整个动画的剧情故事基本上就是在描述一个关于第二次冲击的故事纪事。
在动画的时间线设定当中，在2000年在南极一颗巨大的陨石撞击在了南极的冰山当中，陨石的高温瞬间就造成了很大一部分的冰川的荣华，这直接造成了全球海平面的迅速上涨，在接下来一段时间当中整个地球天在不断，数十亿人直接死在了这陨石引起的一系列自然灾害当中。
时间快速的来到了故事正式开始的2015年，地球又出现了新的不速之客，一种类似人类的巨大生命体开始光临地球，人们将这种东西称之为使徒，也就是说这些东西大概就是上帝派来的使者云云之类的。
这些使徒的最终目的就是要消灭人类，而此时此刻人类手中的武器是无法对于使徒造成伤害的，无论是飞机大炮还是导弹甚至是核武器都没有任何的作用。
因为这个，当时的地球联合组织决定成立了一个强力的军事部门也就是NERV神经元，这个组织在地球联合政府的巨资支持下，加上本身从使徒身上得到的生物细胞还有自身最为顶尖的生命科技以及机械科技，研制成功了一种巨大的人形决战兵器。
这种巨大的人形兵器在体型上并不输给使徒，人们相信这些人形兵器具备消灭使徒的能力，这种兵器在战斗当中直和驾驶员的神经进行连接的战斗模式，而驾驶员在战斗当中就是靠着自身的意志来驾驶这种战斗激起来持续的进行战斗。
不过因为人类本身的技术并不是非常发达的原因，这种人形决战兵器本身也是存在很多不足和限制的地方。在动画的世界当中兵不是每一个人都能够自由的去驾驶EVA来进行战斗，而驾驶员一直都是神经元最为头疼的事情。
整个世界上符合条件的人十分的难以寻找，之后还需要必须经过很长时间的训练才能和EVA本身契合，达到能够战斗的程度。
而在最后全世界在故事开始之前只是寻找到了三名驾驶员，这是三个才十四岁的少男少女，而所有人的希望就全部都寄托在了这三个十四岁的孩子身上。
但是在这一切的背后依然还有巨大的计划在其中，而神经元本身也绝对不仅仅是要去保护人类这么简单，而人类补完计划成为了整个剧情当中最大的一个悬念级别的存在。
当然林焰对于这部动画本身还是有着一些吐槽的，其实这也算的上是一个套路了，那就是米国的超人拯救世界全部都是内衣穿在外。
而日本人拯救世界的全部都是那些小孩子的存在，说实话这种角色的塑造对于日本人来说已经习惯，但是对于其他地区的观众来说，这种拯救世界的主角年龄偏小的问题，还是有些难以接受的，影响观众整体的感受。喜欢游戏开发狂神请大家收藏：(www.zeyuxuan.cc)游戏开发狂神泽雨轩更新速度最快。到泽雨轩（www.zeyuxuan.cc）
看剑来